Краткое техзадание таково:
1) Библиотека хранится в базе данных.         +
2) Разумеется неограниченная вложенность рубрик.      +
3) Разумеется, структура библиотеки хранится отдельно от статей.        +
4) Полнотекстовая индексация статей для возможности релевантного поиска.     +/-
5) Разбивка длинных статей на страницы должна идти без разрыва слов посередине.       +
6) При показе какой-то страницы, из базы должна считываться только эта часть текста, а не статья целиком. 
7) Статью можно комментировать (каменты отключаемые, для каждой статьи индивидуально).  +
---
Далее...
Скачка Java книг нахуй ненужна, это уже старо.  +
Вместо этого сделай конвертацию статьи в FB формат, в инете можешь нагуглить готовые классы для этого, проблем не должно быть. Если будет желание и возможность, можешь сделать еще и в PDF. +/-
pdf http://sourceforge.net/projects/pdf-php/ -
Скачать статью можно как минимум в .TXT и дополнительно в FB2   +/+
Да, и еще забыл...
Надо предусмотреть возможность вставлять картинки, хотя бы одну в начало статьи. +

 1) В списке статей обязательно кроме названия должно выводиться: дата публикации, автор, краткий анонс. +
 Можно еще выводить ссылку на каменты, со счетчиком (чтоб не было нагрузки, последний обязательно надо кэшировать в отдельном поле таблицы со статьями). +

 2) Если к статье прикреплена картинка, то ее можно выводить в список типа как у нас выводятся аватарки у юзеров, такого же размера. +

 Как зашел в статью, там сразу же должна быть картинка (для многостраничных текстов только на 1-й странице) и текст, внизу, в подвале ссылки на скачку и каменты. +
 В этом смысле глянь нашу имеющуюся библиотеку (внешний вид), так и должно быть. +
 
 По поводу использования класса и создания превьюшки, глянь анкеты, как там выгружается личное фото. +
 Для превьюшек создавай отдельную картинку, чтоб не насиловать сервер.      +
 То есть, при выгрузке картинки, у тебя на сервер должны ложиться 2 файла: первый 32х32, +
 квадратный (класс upload позволяет так обрезать) для превьюшек списка статей,  +
 а второй уже для самой статьи, нужного тебе размера. +
 
 А когда кликнешь на саму картинку, можно показать увеличенный вариант. +
 Но это я имею в виду при чтении самой статьи. В списке статей такого (кликабельная картинка) делать не надо. +
 
Нафига ты выгружаемые картинки пихаешь в каталог /images он ведь у нас только для чтения? +
Для всех файлов библиотеки резервируй /files/library/ и далее пихай туда что хочешь.       +
 
Учти это в коде. И когда будет писаться конвертер, то нам ОБЯЗАТЕЛЬНО надо сохранить ID статей. + 

1) К примеру, на кой хуй ты кинул служебные ссылки (типа создать категорию и т.п.) наверх?
 Этим пользуются редко и к тому же, это модерско-админская функция. А эти функции у нас везде расположены внизу.

 2) Никаких диалоговых окон на белом фоне, все должно быть оформленно красиво, к примеру как на форуме окна "написать".

 3) Никаких сообщений "пусто" к тому же с маленькой буквы. Если ничего нет, используй системную фразу по ключу 'list_empty' к тому же размещай это в диве "menu" и в тэгах параграфа, как сделано везде в двиге.
 На старую библиотеку внимание не обращай и не бери ее за основу, если бы она была бы хороша, мы бы ее не меняли.

 4) Ссылки редактирования "вверх" "вниз" размещены вообще в белом поле, вне Дива, это вообще ошибка начинающих быдлодизайнеров, 
 мы такое ни в коем случае допускать не должны. К тому же, у тебя светятся эти надписи без ссылок. 
 Ссылку не убирай, на сортировку все равно не повлияет, но для глаз будет приятнее.