$file = file('file.txt');
for($i=0; $i<count($file); $i++){
if(round($i/2)==$i/2){
$file[$i] = base64_decode($file[$i]);
}
}отформатировал
$file = file('file.txt');
for($i=0; $i<count($file); $i++){
if(round($i/2)==$i/2){
$file[$i] = base64_decode($file[$i]);
}
}