Просмотр поста #15825: Он-лайн ftp

Шел будет работать частично на нормальном хосте. Т.Е. для него будет доступно только чтение в папках с правами 755 и на файлах с правами 644. А изменение/удаление будет доступно только с 777. Так что шелом можно будет мало что сделать если на хостинге нормально работают права.
С фтп другая история, при доступе с фтп имеются все права на все папки вне зависимости от прав выставленных на них (не зависимо от того на каком сайте стоит скрипт фтп менеджера).
ФТП на своём сайте будет работать быстрее чем стоящий на другом сервере (проверено лично).