Евген, загрузчик как ни крути затрёт, но в этом ничего страшного нет, т.к. поверх должен поставится тот же самый. Единственное так это могут версии отличаться. Ну или ты себе lilo вместо grub 2 поставишь, но обычно всегда все ставят grub 2, если на счет этого собственных соображений нет, и поэтому по дефолту у большинства дистров grub 2, хотя в некоторых есть возможность выбора загрузчика.
Если вдруг Kubuntu не найдется, то грузишься из под сюси и ищешь файл /boot/grub/menu.lst и смотришь этот топик http://forum.ubuntu.ru/index.p ... 165.0