вообще как бы софт разметки из под оси работает криво, для начала я бы проверил диск на ошибки, свойства диска сервис, или через администрирование
я читал тему, но почему то думал и так решите
если косяки подобные появились надо вообще покорностью переразбить и переформатировать жесткий, а то о один прекрасный момент например отвалится мбр, или повредится мфт и прочее