Насчет ссылок, действительно, современным поисковикам уже давно наплевать на вид ссылок.
1) Робот заходит на главную страницу, считывает ее, анализирует
2) Определяет, какие тексты являются ссылками и следует по ним (в пределах домена).
---
А какая ссылка. ему все равно. Главное, чтоб она находилась внутри домена.
---
Это еще на заре развития поисковых технологий были проблемы с мудренными ссылками, щас уже нет.
Другое дело, как ссылка выглядит для восприятия человека. К примеру, переходить по ссылке ваш_домен/ник и попадать на профиль намного удобнее и нагляднее, чем ваш_домен/index.php?user=3401