$array = array();
while ($res = mysql_fetch_array($req)) {
$array[] = $res['id'];
}
mysql_query("UPDATE `cms_forum_rdm` SET
`time` = '" . time() . "'
WHERE `topic_id` IN('" . implode(',',$array) . "') AND `user_id` = '$user_id'");
также можно c ArrayObject поиграться