Можно обрабатывать фотографии налету, но это будет слишком медленно если будут большие фотографии и их будет вдобавок много.
В одной папке хранить прям много фоток не самая хорошая идея. Если там будет максимум тысяча фоток, можно не париться, если больше, то лучше конечно разбрасывать фотографии по нескольким папкам.
Хранить лучше оригинал и делать сжатую копию для предпросмотра.