Windler, 1. Если ты записываеш время как изначально заданную переменную
Например:
$time = time();
//запись в базу 1
//запись в базу 2то однозначно время изменится не сможет
2. если ты вызываеш фунцию time() при каждой записи то вот тут я не уверен но скорей всего некоторая разница во времени быть всеже может особенно если время выполнения скрипта довольно большое
3. Если тебе нужно чтоб время расходилось на 1 секунду можно сделать так
$time = time();
//запись в базу 1 ($time)
//запись в базу 2 ($time + 1)