не понял что ты там с empty() сделал, но можно так
if (mysql_result(mysql_query("SELECT COUNT(*) FROM `таблица с коммами` WHERE `id` = '".$id."'"), 0) == 0)
echo '<div class="rmenu">Ошибка! Такого комментария не существует</div>';
else {
ну а тут если существует
}