Правда можно сделать что бы ошибки не было... Открыть /incfiles/core.php и в самом начале файла перед или после комментария вставить эту константу:
define('_IN_JOHNCMS', 1);
Или есть другой вариант выпилить проверку установки константы со всех файлов в папке /incfiles/. Сама проверка собой представляет вот что:
defined('_IN_JOHNCMS') or die('Error: restricted access');
После этого можно не добавлять во все файлы определение этой константы и выпилить его(определение константы) со всех файлов движка.