$url = check($url);
$name = check(mb_substr($name, 0, 200));
mysql_query("INSERT INTO `favorites` SET `user_id`='$user_id', `time` = '$realtime', `name`='$name', `url`='$url'");
перед этим надо добавить условие
$valid_url = mysql_result(mysql_query("select count(*) from `favorites` where `user_id` = '" . $user_id . "' and `url` = '" . $url . "'), 0);
if ($valid_url > 0) {
# есть уже такая закладка
} else {
# тут запрос на добавление
}